「経費削減」という派遣会社側の理由から考えると、条件は変えてもらえない可能性があります。ちなみに、仮に定期券を紛失した場合、JRでは再発行してもらえるシステムがありますので、問題ないと思いますが、HIROさんの路線ではいかがでしょうか。とにかく、派遣会社に交渉する際は、HIROさんがなぜ6ヵ月分の定期券を購入すると困るのか、その理由を単純明快にお伝えください。

具体的には、
・ 6ヵ月分の定期代は高額になるため、なくしたら困る
・ しかし、1ヵ月ずつ購入すると、支給される定期代との差額が6ヵ月間で2万円以上に
なってしまう。
の2点を、実際の金額を提示しながらお話ししてみてください。

もし、それでも難しいようでしたら、少し譲歩して、3ヵ月分の定期に変えてもらえないか相談してみてはどうでしょう。派遣だけではなく、正社員でも、経費削減のために交通費を6ヵ月分支給する企業も多いので、難しい交渉かもしれませんが、きちんと言うべきことだけは言ってみてくださいね。